รายชื่อหน่วยงาน
| สำนัก/กอง ส่วนกลาง | สำนักงานชลประทานที่ 1-17 |
| สำนักงานเลขานุการกรม | สำนักงานชลประทานที่ 1 |
| กองการเงินและบัญชี | สำนักงานชลประทานที่ 2 |
| กองแผนงาน | สำนักงานชลประทานที่ 3 |
| กองพัฒนาแหล่งน้ำขนาดกลาง | สำนักงานชลประทานที่ 4 |
| กองพัสดุ | สำนักงานชลประทานที่ 5 |
| ศูนย์เทคโนโลยีสารสนเทศและการสื่อสาร | สำนักงานชลประทานที่ 6 |
| สำนักกฎหมายและที่ดิน | สำนักงานชลประทานที่ 7 |
| สำนักเครื่องจักรกล | สำนักงานชลประทานที่ 8 |
| สำนักงานจัดรูปที่ดินกลาง | สำนักงานชลประทานที่ 9 |
| สำนักงานบริหารโครงการ | สำนักงานชลประทานที่ 10 |
| สำนักบริหารจัดการน้ำและอุทกวิทยา | สำนักงานชลประทานที่ 11 |
| สำนักบริหารทรัพยากรบุคคล | สำนักงานชลประทานที่ 12 |
| สำนักพัฒนาแหล่งน้ำขนาดใหญ่ | สำนักงานชลประทานที่ 13 |
| สำนักวิจัยและพัฒนา | สำนักงานชลประทานที่ 14 |
| สำนักสำรวจด้านวิศวกรรมและธรณีวิทยา | สำนักงานชลประทานที่ 15 |
| สำนักออกแบบวิศวกรรมและสถาปัตยกรรม | สำนักงานชลประทานที่ 16 |
| กลุ่มตรวจสอบภายใน | สำนักงานชลประทานที่ 17 |
| กลุ่มพัฒนาระบบบริหาร | |
| กองพัฒนาการบริหารจัดการน้ำและการมีส่วนร่วม | |
| กองประสานงานโครงการอันเนื่องมาจากพระราชดำริ | |
| สถาบันพัฒนาการชลประทาน |